_ KNOB 2.0.0をリリース

やっとこさ, バイオインフォマティクス向け Live CD Linux であるKNOB 2.0.0 (KNOPPIX for Bio) をリリースしたよ.

主な変更点は以下の通り

• Knoppix 4.x系にアップグレード
• 起動の高速化
• Javaが搭載された
• Tavernaを搭載したため, 簡単にワークフローによる解析が可能になった.
• 高速化ツールキット "LCAT"により起動時間が5倍速くなった.
• ゲノムデータへのアクセスができるようになった
  • BioRubyのBio::Ensembl によってゲノム配列の取得が容易になった.
  • Taverna の biomart pluginによって, Ensembl mart にアクセスできるようになった.
• ChemRubyを収録した.
• Intel Mac での動作を確認した.
• Intel Mac と Parallels Desktop for Macの組み合わせでの起動を確認した.
• emboss.defalutの GENBANKNをGENBANKに変更
• その他, パッケージのバージョンアップ

パッケージリストなどは以下を参照.

http://knob.sourceforge.jp/ja/index.php?KNOB2.0.0

今回のリリースから KNOB Project への参加者が増えた 今回のリリースに主な貢献をした参加者を挙げておく.

• 二階堂 愛 (KNOB Project Leader) / RIKEN CDB/Saitama Medical University (←俺)
• 山本 剛とゆかいな仲間たち@富士通SSL
• 池 泰弘@うさぴょんソフトウエア製作所

ご協力ありがとうございました.

KNOB Projectへの参加については, 以下をみてね.

あなたができるKNOB Project への9つの貢献